③实验中使用 RNase-free 的试剂和耗材。实验室可以选择使用1‰ DEPC 去浸泡枪头和 EP 管获得 RNase-free 耗材,但是由于 DEPC 是一种强烈的致癌物,已逐渐被实验室抛弃。近几年,商品化的 RNase-free 的试剂和耗材逐渐兴起,实验人员可以选择以保证实验的安全。
赛默飞将在6月15日19:00为大家带来一场精彩的直播。直播的内容涉及 RNA 提取、RNA 定量、RT-PCR 以及琼脂糖电泳的实操讲解,直播过程中更有专属礼品发放等你拿!大家可以扫描下方二维码进行观看。
RNA 的质量评价一般分为三个方面:RNA 的纯度、RNA 的浓度以及 RNA 的完整性。对于 RNA 的纯度和浓度可以使用 NanoDrop 分光光度计进行检测。纯的 RNA 一般情况下 OD260/OD280 的值为2。如果样品中如果含有蛋白质、苯酚等,A260/A280 比值会明显下降。OD260 反映的是溶液中核酸的浓度,但是当 RNA 浓度较低,或者 RNA 中存在 DNA 污染时,紫外分光光度法不能准确定量 RNA 的浓度。
RT-PCR 目前分为传统的两步法和一步法两种方法。传统的两步法包括:RNA 逆转录为 cDNA 和以 cDNA 为模板进行 PCR。而一步法中,RNA 的逆转录(RT)和 cDNA 的扩增在同一反应管中完成。相比单独的两步法,一步法工作流程更更简单,需要的移液步骤更少,这样可以更快地拿到结果并*大程度地减少污染。
下面是我们为大家分享的基因克隆实验中的一些实验环节小秘籍,让我们一起为科研助力,为研发加油!
目前,市场上提取 RNA 的产品很多。大致分为三个基本的类型:有机试剂产品、硅膜柱产品以及磁珠产品。需要注意,针对不同的样品需要选择合适的 RNA 提取试剂,例如:提取植物 RNA 时由于有些植物组织含有的酚类和糖类较多,因此需要特殊的 RNA 提取试剂。在这里,我们为大家推荐一款实验室普遍应用的 RNA 提取试剂:TRIzol Reagent。
以2021年1月7日 Nature 发表的一篇题为:Genomic basis of geographical adaptation to soil nitrogen in rice 的研究论文为例,文章通过熟练的运用基因定位与基因克隆技术鉴定到 OsTCP19 一个启动子区域的突变和氮素响应的水稻分蘖表型关联,进而阐明基因的等位基因和不同地理区域的土壤氮素含量相关。这也提示了我们基因定位与克隆技术对于科研发现的重要性。图片来源:Nature
④RNA 提取中尽量选择新鲜的实验样品,缩短采样和提取的间隔以避免 RNA 被内源 RNase 降解。不能及时处理的样品需要用液氮速冻并保存在-80℃冰箱中。当以上操作无法被满足时,推荐使用 RNAlater™ RNA Stabilization Solution 来保存样品。RNAlater™ RNA Stabilization Solution 能够迅速抑制内源RNase活性,保护 RNA 不被降解,使数据更可靠。并且 RNAlater™ RNA Stabilization Solution 适用于多种样本类型,并与多数 RNA 分离试剂兼容,满足不同实验需求;可以在不同温度下保存样品,方便运输/保存样本。图片来源:Thermo Fisher
大家是不是还有很多关于 RNA 提取以及 RT-PCR 的问题需要解决?
②提供专用的 RNA 提取操作环境,例如专用的操作实验台或者专用的安全柜。需要注意的是普通的酒精喷洒并不能有效去除操作环境中的 RNA 酶。在这里我们为大家推荐两款自己使用比较好的产品:RNaseZap™ RNase 去污溶液和 RNase Zap™ RNase 去污湿巾。这两款产品可以失活外源 RNase,创造更清洁的 RNA 实验环境,可用于实验台面、移液器、玻璃器皿等表面的处理,满足多种需求。图片来源:Thermo Fisher
原创 生物世界 生物世界近几年国内科研水平不断提高,国内科学家在 CNS 正刊上屡有斩获,我们*近对文献的梳理发现,聚焦在基因定位和克隆领域的文章占比较高。基因定位和克隆算是*经典的研究方向,每年仅就基因的发现与功能研究的文章就数不胜数,另外以基因克隆为技术支持的文章多次登上 Nature、Science、Cell 三大神刊。
TRIzol Reagent 是由赛默飞生产的一款完整、即用型试剂,可从多种生物样品中分离高质量的总 RNA。它拥有卓越的裂解能力,甚至可处理困难的样品类型。Phasemaker 管含有粘稠的聚合物,可将 TRIzol 试剂混合物的上层水相与下面的有机相分开并完全分离,从而大大简化吸取含有 RNA 上层水相这一步骤的操作。TRIzol Reagent 搭配 Phasemaker 管使用,操作更简单,RNA 产量可以提高多达30%。图片来源:Thermo Fisher
赛默飞推出“翱翔六月直播间”活动,为你准备了实验室的现场直播,亲自演示解答实验过程的环节~扫描下方二维码进入,超多干货的直播内容等你观看!
原标题:《老树发新芽,经典研究方向也能发Nature,带你了解研究背后的技术细节》
除了 SuperScript™ IV 逆转录酶,赛默飞提供的 E-Gel™ Power Snap 核酸电泳系统为检测提供了便利条件,使用干式预制预染 E-Gel 琼脂糖凝胶进行电泳,大大简化了电泳前准备工作。相机可直接接入电泳仪,无需外部电源或连接台式计算机,可实时查看和捕获样品图像。图片来源:Thermo Fisher
RNA 的完整性可以通过琼脂糖凝胶电泳进行评估。对于哺乳动物细胞提取的 RNA,未降解的总 RNA 电泳时在凝胶中会出现 28S、18S 和 5S rRNA 对应的条带,28S 的亮度为 18S 的两倍。如果有 DNA 污染则在 RNA 后会发现基因组 DNA 对应的条带。图片来源:Thermo Fisher
SuperScript™ IV 一步法 RT-PCR 系统,组合了性能*强的逆转录酶 SuperScript IV 和 PCR 酶 Platinum SuperFi,拥有*高的灵敏度和*快的反应时间;采用两步热启动法,不仅能获得*高的特异性,也能在室温配置体系,更加适合高通量实验。图片来源:Thermo Fisher
说到 RNA 提取,*主要的就是保证 RNA 的完整性,它是后续实验成功的关键。但是由于外界环境中无处不在的 RNA 酶以及 RNA 结构易降解的特殊性,导致 RNA 在提取中极易降解。那么如何防止在提取过程中 RNA 被降解呢?
Qubit 荧光计采用专门研制的荧光检测技术,该技术采用只有与 DNA、RNA 或蛋白质结合后才发出荧光的 Molecular Probes 染料。这些荧光染料只有与特异性的靶分子结合时,才能发出荧光信号,即使有游离核苷酸存在时亦是如此。由于 Qubit 技术只检测靶分子(而不是污染物)的浓度,因此这种特异性可以使您获得十分精确的结果。即便对于低浓度样品,Qubit 荧光定量亦具有出众的 DNA 和 RNA 定量特异性和灵敏度。
在基因克隆的整个实验流程里你遇到过哪些棘手的问题呢?想了解如何无降解地提取出完整的 RNA 吗?想知道如何通过 RT-PCR 扩增出目的基因吗?